Han pasado tres semanas desde que la Colonia Espacial Eurasia fue tomada por Sigma y dirigida por el Dínamo para colisionar con la Tierra. Zero hizo un ataque de choque contra la colonia. Aunque X y Zero tuvieron éxito, la explosión dañó gravemente la Tierra y necesita reparaciones. X sólo regresó a la batalla y Zero se cree que está muerto. Eso es hasta una nueva amenaza conocida como, "Zero Nightmare" es en general y causar estragos en los seres humanos y reploids. ¿Está vivo Zero? ¿X finalmente pondrá fin a la amenaza Maverick? Ver Pelicula Mega Man X6 Online Latino