Es el año 4444. Tierra se ha convertido en un planeta prisión para los criminales, terroristas y muchos otros rebeldes políticos. Bill Rizer ha sido asignado a una nueva pareja, un samurai extranjero nombrado Genbei Yagyu, o Jaguar. Su misión es hacer frente a la amenaza Neo Contra, y derrotar al Alto Mando de la organización Neo Contra, Guerrilla Contra, un piloto del tanque robot y fumador de pipa comandante militar, Planta Contra, una planta híbrida cyborg, Feromonas Contra, la única mujer miembro del Neo Contra, que tiene conexiones con Bill Rizer del pasado, y Contra los Animales, un bull terrier que habla y que sirve como un capitán de un portaaviones, antes de tratar con el líder de sombras de Neo Contra, Maestro Contra, que también tiene vínculos con Bill Rizer. Ver Pelicula neo Contra Online Latino